Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTCH1Q13635 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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