Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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