Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ENPP4-201ENST00000321037 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS2-206ENST00000393528 3043 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS16-202ENST00000380445 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079779.1-201ENST00000437798 4775 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NOP2-202ENST00000382421 2736 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LYPD6-201ENST00000334166 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EMC1-202ENST00000375208 4084 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN5A-205ENST00000423572 8362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3HC1-201ENST00000311873 2017 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EDNRB-201ENST00000334286 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-289ENST00000640807 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TTI2-201ENST00000360742 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM111A-211ENST00000533703 4202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KLC2-202ENST00000394065 3755 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AOX1-202ENST00000374700 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM23-204ENST00000399922 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC055716.2-201ENST00000552545 2441 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 COL5A2-203ENST00000618828 6399 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-240ENST00000638575 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-245ENST00000638759 3723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-264ENST00000639544 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPKBP1-202ENST00000457542 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NHLRC3-203ENST00000470258 3298 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 COL10A1-202ENST00000327673 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NUMB-202ENST00000356296 3453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SPIN4-201ENST00000374884 4117 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNA2-203ENST00000402739 3684 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMA3-AS1-214ENST00000557660 2360 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM198B-202ENST00000393807 4544 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND11-205ENST00000381607 3898 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02204-201ENST00000630447 3206 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL662907.2-201ENST00000624339 3448 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC132825.4-201ENST00000582527 3644 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PDZK1IP1-202ENST00000371885 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DDR1-227ENST00000376570 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CST9LP1-201ENST00000376987 444 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 U2AF1L4-202ENST00000378975 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms