Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 MIR3663-201ENST00000583207 97 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC006269.1-201ENST00000636752 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 CD274-202ENST00000381577 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 AP001528.3-201ENST00000624364 3249 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRHP20396 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 RN7SKP139-201ENST00000410411 293 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 CYB5D1-201ENST00000332439 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 CERS6-AS1-201ENST00000425636 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 KCNJ15-205ENST00000398930 2914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRHP20396 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 CABYR-202ENST00000399481 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 PPARGC1A-206ENST00000507380 2385 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 TRIM16-212ENST00000578237 3206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms