Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN6Q9Y6Q1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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