Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243 ms