Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2J1Q9Y385 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms