Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms