Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAN1Q9Y2M0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms