Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX4Q9Y2E6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms