Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS2Q9Y248 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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