Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT1Q9Y234 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms