Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms