Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM35Q9UPQ4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM35Q9UPQ4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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