Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms