Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRQQ9UMZ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms