Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms