Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ALKQ9UM73 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALKQ9UM73 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms