Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKLN1Q9UL63 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKLN1Q9UL63 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKLN1Q9UL63 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKLN1Q9UL63 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKLN1Q9UL63 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKLN1Q9UL63 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKLN1Q9UL63 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKLN1Q9UL63 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKLN1Q9UL63 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKLN1Q9UL63 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKLN1Q9UL63 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKLN1Q9UL63 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKLN1Q9UL63 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms