Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO4Q9UKT5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms