Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms