Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms