Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms