Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms