Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC10Q9NYD6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms