Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY46

SCN3A, Sodium channel protein type 3 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3AQ9NY46 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCN3AQ9NY46 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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