Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms