Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms