Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms