Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1Q9HCU9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms