Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CWC22Q9HCG8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms