Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms