Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA6AQ9H2E6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6AQ9H2E6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms