Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms