Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCSER1Q9C0I3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms