Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms