Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms