Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
KRTAP2-4Q9BYR9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms