Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC11CQ9BY50 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms