Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms