Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDCA4Q9BXL8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms