Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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