Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms