Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms