Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms