Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP19Q99542 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms