Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAT1Q99536 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms