Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRBNQ96SW2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms