Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms