Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms